根據指導意見的內容，將重點規劃完善三大棉花物流通道，包括新疆棉花物流通道，主要是滿足新疆棉花及中亞國家進口棉花流入內地需求；內地棉花物流通道，主要是滿足華東、華中、華北等地區棉紡企業用棉需求；沿海地區進口棉花物流通道，主要是滿足國內企業對進口棉花的物流需求。
另外，研究開展棉花集裝箱運輸試點，打破制約棉花集裝箱運輸發展的“瓶頸”，建設從新疆到內地集收納、集并、中轉、運輸、存放等為一體的棉花集裝箱運輸物流體系，實現“門到門”的棉花集裝箱聯運服務。
在投融資渠道方面，鼓勵棉花骨干企業多渠道籌集建設資金，參與物流信息化、標準化，以及重要物流通道和節點基礎設施建設，中央和地方有關部門可通過現有投資渠道給予一定資金支持。引導銀行業金融機構加大對棉花物流企業的信貸支持力度，支持符合條件的企業通過發行公司債券、企業債券和上市等多種方式拓寬融資渠道，支持企業發行非金融企業債務融資工具籌集資金。
同時，提升棉花物流信息化水平，加大政策支持力度，鼓勵鐵路運輸企業要加大出疆棉花運力投入。落實支持物流業發展的用地和相關稅收優惠政策，有關地方進一步完善出疆棉花運費補貼操作辦法。同時，支持棉花物流企業兼并重組、做大做強。
