補貼工作按照“誰種棉，補給誰”的原則，確保棉農直接受益。省發改委在實施方案中指出，省財政部門依據省農業部門提供的2014年棉花良種補貼種植面積將補資金切塊下達省轄市和有關縣(市)。
方案明確，各縣(市、區)以棉花良種補貼種植面積為基礎，據實核定、發放補貼資金，本縣(市、區)范圍內統一標準。各地不得從補貼資金中預留備用金，補貼資金不得結余結轉。
方案規定，補貼資金實行專戶管理，封閉運行。河南省補貼資金全部納入糧食風險金專戶進行管理和撥付，并與專戶內其他資金分賬核算，單獨反映。補貼資金由各縣(市、區)財政局通過“一卡(折)通”兌付給種棉農民。
據了解，在新疆開展棉花目標價格改革試點的基礎上，國家對內地棉花主產區實施補貼。這是一項重要惠農政策，旨在通過補貼的激勵效應，更好地調動內地主產區和棉農種植棉花的積極性，發揮市場在資源配置中決定性作用的同時，統籌兼顧農藥、化肥、人工等農業生產要素價格上漲對種棉成本的影響，合理引導棉花生產、流通、消費，鼓勵多種棉、種好棉，保持棉花種植面積和產量穩定，促進農業生產發展和農民增收。
